2010年3月11日星期四

FreeRange story - 人体肠道菌群元基因组研究

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"人体肠道菌群元基因组研究"

人体内居住的微生物细胞总数估计高达100万亿,是人体本身细胞总数的10倍。编码微生物细胞的基因数量估计是人类基因的100倍。这些细菌大部分寄生在人的肠道中,通称为肠道菌群,它们通常被称作"人体肠道元基因组"。DNA24 写道 "由华南理工大学"基因组科学"创新班学生李俊桦、谢寅龙作为署名作者,深圳华大基因研究院主要承担的《人体肠道菌群元基因组参考基因集的构建工作(全文)》研究,在《自然》杂志上以封面故事形式发表。" 研究人员收集了124个来自于欧洲人肠道菌群的样本,采用了新一代大规模高通量的测序技术进行深度测序,产出近6千亿的碱基序列。经过序列组装和基因注释分析,从中获得330万个非冗余的人体肠道元基因组的参考基因,约是人自身基因的150倍。这个基因集中包含了绝大部分目前已知的人体肠道微生物基因,但更多的是目前未知微生物的基因。从这个基因集中可以估计人肠道中存在约1000到1150种细菌,平均每个体内约含有160种优势菌种,并且这些细菌是绝大部分个体所共有的。这项研究成果有助于揭示肠道菌群的基因组成与肥胖、肠炎病的关系。

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